MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nitrosococcus watsoni C-113 plasmid pNWAT01

Total Repeats: 149

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014316	TGGT	2	8	699	706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014316	GTG	2	6	780	785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014316	CGCT	2	8	801	808	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014316	GCC	2	6	809	814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_014316	GTTG	2	8	879	886	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014316	GCC	2	6	954	959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_014316	CGC	2	6	973	978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_014316	GCC	2	6	1283	1288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_014316	GTCTG	2	10	1329	1338	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014316	AGG	2	6	1363	1368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014316	GATT	2	8	2073	2080	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014316	TTG	2	6	2091	2096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014316	AT	3	6	2108	2113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014316	TTCT	2	8	2151	2158	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014316	AT	3	6	2216	2221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014316	CTTT	2	8	2501	2508	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014316	CTA	2	6	2529	2534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014316	AGCA	2	8	3981	3988	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014316	GGC	2	6	4956	4961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014316	CCGC	2	8	4976	4983	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
21	NC_014316	CAG	2	6	5512	5517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014316	TCT	2	6	5533	5538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014316	AGC	2	6	5616	5621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014316	CTT	2	6	5984	5989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014316	TC	3	6	6035	6040	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014316	TTA	2	6	6045	6050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014316	CAC	2	6	6111	6116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_014316	AAGA	2	8	6156	6163	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014316	T	6	6	6236	6241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014316	TC	3	6	6244	6249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014316	TA	4	8	6256	6263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014316	TA	3	6	6267	6272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014316	T	7	7	6527	6533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014316	TA	3	6	6547	6552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014316	AGT	2	6	7575	7580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014316	AG	3	6	8965	8970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014316	TAGTT	2	10	8978	8987	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014316	TCA	2	6	9004	9009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014316	TTC	2	6	9666	9671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014316	ATT	2	6	10181	10186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014316	TATT	2	8	10218	10225	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014316	CA	3	6	10264	10269	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_014316	GAATA	2	10	10371	10380	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014316	GAATA	2	10	10408	10417	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014316	ACA	2	6	10425	10430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014316	GGT	2	6	10491	10496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014316	CGC	2	6	10500	10505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_014316	TTA	2	6	10564	10569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014316	CCCT	2	8	10592	10599	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_014316	AGC	2	6	10626	10631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014316	AGCG	2	8	10634	10641	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014316	TGG	2	6	10735	10740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014316	GC	3	6	10795	10800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014316	CGGC	2	8	10818	10825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014316	TTTA	2	8	10909	10916	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014316	TAAG	2	8	10929	10936	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014316	CCA	2	6	10972	10977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_014316	A	6	6	10983	10988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014316	AG	3	6	10991	10996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014316	ATC	2	6	11021	11026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014316	A	8	8	11041	11048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014316	GCA	2	6	11050	11055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014316	CGC	2	6	11085	11090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_014316	GAC	2	6	11160	11165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014316	T	6	6	11181	11186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014316	ATT	2	6	11202	11207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014316	GTAA	2	8	11222	11229	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014316	ATT	2	6	11262	11267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014316	TC	3	6	11269	11274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_014316	TC	3	6	11314	11319	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014316	TC	3	6	11330	11335	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014316	A	6	6	11418	11423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014316	ACTTAA	2	12	11426	11437	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_014316	GTC	2	6	11440	11445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014316	TAG	2	6	11964	11969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014316	ATTA	2	8	11993	12000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014316	AAT	2	6	12031	12036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014316	TAT	2	6	13915	13920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014316	TA	3	6	13929	13934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014316	T	6	6	15629	15634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014316	ATG	2	6	15675	15680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014316	GA	3	6	17063	17068	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014316	GAT	2	6	17091	17096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014316	A	7	7	17150	17156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014316	AAG	2	6	17226	17231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014316	GA	3	6	17251	17256	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014316	GGAA	2	8	17297	17304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014316	TCT	2	6	18057	18062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014316	TAT	2	6	18138	18143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014316	ATT	2	6	18240	18245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014316	GCG	2	6	18419	18424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014316	CCG	2	6	18511	18516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_014316	CCA	2	6	18517	18522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_014316	GCTG	2	8	18591	18598	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_014316	GAA	2	6	18599	18604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014316	GAGTT	2	10	29453	29462	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014316	GA	3	6	29494	29499	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014316	ATG	2	6	29511	29516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014316	CAA	2	6	29554	29559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014316	T	6	6	29564	29569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014316	AATTA	2	10	29600	29609	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014316	GT	3	6	29611	29616	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014316	GAA	2	6	29628	29633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014316	CTC	2	6	29655	29660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_014316	TAC	2	6	29714	29719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014316	A	7	7	31292	31298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014316	TA	3	6	31303	31308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014316	A	6	6	31315	31320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014316	TCAAA	2	10	31340	31349	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_014316	CCG	2	6	31502	31507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_014316	A	6	6	31574	31579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014316	AG	4	8	31581	31588	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014316	TAC	2	6	31623	31628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014316	GAAAT	2	10	31818	31827	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014316	GAA	2	6	33563	33568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014316	GAT	2	6	33584	33589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014316	TGA	2	6	33615	33620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014316	TGA	2	6	33629	33634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014316	TTCC	2	8	33710	33717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_014316	TCC	2	6	34458	34463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_014316	TTC	2	6	34638	34643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014316	CAA	2	6	34697	34702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014316	GA	3	6	34725	34730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014316	CTG	2	6	34734	34739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014316	CCG	2	6	34771	34776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_014316	ACT	2	6	34790	34795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014316	TGT	2	6	34810	34815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014316	CGGC	2	8	34872	34879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_014316	GTG	2	6	34887	34892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014316	GCT	2	6	34930	34935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014316	AAG	2	6	34981	34986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014316	CAG	2	6	35038	35043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014316	A	6	6	35075	35080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014316	ATA	2	6	35108	35113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014316	AAGGTT	2	12	35156	35167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014316	CTT	2	6	35187	35192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014316	CTT	2	6	36494	36499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014316	CT	3	6	36540	36545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_014316	CT	3	6	36562	36567	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_014316	TA	3	6	36570	36575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014316	GAA	2	6	37879	37884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014316	GT	3	6	38685	38690	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014316	AATA	2	8	38710	38717	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014316	TC	3	6	38785	38790	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_014316	CGT	2	6	38807	38812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_014316	TAAA	2	8	38843	38850	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014316	TTC	2	6	38913	38918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_014316	CGT	2	6	38987	38992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_014316	GGCGC	2	10	39091	39100	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.